Linzhi terletak di dataran tinggi di kawasan hilir Sungai Yarlung Zangbo dengan ketinggian 3,100 meter dari paras laut. Linzhi merupakan kawasan yang lokasinya paling rendah di Tibet.
Linzhi mempunyai cuaca yang amat nyaman pada musim panas dengan suhu udara antara 14 hingga 23 darjah Celsius.